El clima pertenece a la franja de frío continental con estación seca.

Las temperaturas y precipitaciones no son uniformes en el área ocupada pro el Parque Nacional.

Una importante variación de las lluvias se produce de Oeste a Este, entre el límite con Chile y el Río Limay respectivamente. Por su parte, las temperaturas disminuyen marcadamente desde las laderas bajas hacia la cumbre de los Cerros. Estas variaciones climáticas a las que se suman diferencias en cuanto a suelos, relieves y geomorfología y dan por resultado importantes cambios en la vegetación y fauna.

En verano los días son cálidos y soleados, con noches frescas, escasas lluvias y vientos predominantes del sudoeste. Por la latitud en que se encuentra esta ciudad, la luz del día se prolonga hasta cerca de las 22hs. La temperatura promedio es de 18º C. con máximas de 29ºC y mínimas de 9ºC.

En otoño los días son frescos - templados con noches frías. La temperatura oscila entre los 4ºC y los 13ºC. En esta época predominan las lluvias.

En invierno los días son muy fríos con abundantes precipitaciones niveas. Las temperaturas oscilan entre 8ºC y -10ºC.

En primavera hay días frescos que comienzan a alargarse y a elevar paulatinamente la temperatura, disminuyendo lentamente el caudal de precipitaciones. Las noches son frías, manteniendo durante el día temperaturas que oscilan entre los 7ºC y los 20ºC hacia el final de la temporada.